Araş. Gör. Dr. Uğur Akpulat - Hacettepe Üniversitesi Tıbbi Biyoloji
Transkript
Araş. Gör. Dr. Uğur Akpulat - Hacettepe Üniversitesi Tıbbi Biyoloji
Araş. Gör. Dr. Uğur Akpulat Yazışma Adresi Hacettepe Üni. Tıp Fak. Tıbbi Biyoloji A.D. 06100 Sıhhiye/Ankara Telefon 0 312 305 25 41 Faks 0 312 309 60 60 e-mail Uakpulat (@) hacettepe.edu.tr EĞİTİM DURUMU 2008 - 2014 Doktora (Ph.D.), Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Ankara 2003 - 2006 Yüksek Lisans (M.Sc.), Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı / İzmir 1998 – 2003 Lisans, Ege Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümü, Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Ağırlıklı Lisans Programı AKADEMİK ve ÖZEL SEKTÖR İŞ GEÇMİŞİ 2008 - ... Hacettepe Üniversitesi Kastamonu Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı, Araştırma Görevlisi 2005 – 2008 GENTAN / Özel Genetik Tanı Laboratuarı-İzmir, Uzman 2003 – 2006 Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı, Proje Asistanı BİLİMSEL ARAŞTIRMA ALANLARI Moleküler Hücre Biyolojisi Kronik iskelet kası dejenerasyonu, İskelet kası gelişimi moleküler regülasyonu, Satellit hücre biyolojisi Genetik Hastalıkların Tanısı (prenatal, postnatal, kanser) Tek gen hastalıklarının mutasyon analizi, Sitogenetik, Moleküler sitogenetik HAZIRLADIĞI TEZLER Doktora Tezi Fare Miyoblast Hücre Hattında Klf5 Geninin Farklılaşma Sürecine Etkilerinin Araştırılması. Danışman öğretim üyesi: Prof. Dr. Çetin KOCAEFE Yüksek Lisans Tezi Maternal Periferik Kandan Fetal Genomik DNA’nın Belirlenmesi. Danışman öğretim üyesi: Yrd. Doç. Dr. Çiğdem ERESEN GÖREV ALDIĞI PROJELER Fare Klf5 Genine Bildirici Etiket Dizisinin Yerleştirilmesi ve Protein Etkileşimlerinin Belirlenmesi. HÜBAB Projesi, Proje No: 2115, 2014-2016 Klf5 Transkripsiyon Faktörünün Kas Dokusu Farklılaşmasındaki Rolü ve Hedef Genlerinin Araştırılması. TÜBİTAK_110S364, 2011-2013. Fare Miyoblast Hücre Hattında Kalıcı ve Uyarılabilir Nitelikte Klf5 Gen İfadesinin Susturulması. HÜBAB Projesi, Proje No: 5813, 2011-2012 Genetik Kökenli Enzim Eksiklerine Yönelik Enzim Replasmanı Sağlamak Amacıyla Yağ Hücrelerinin Yeniden Programlanması ve Tedavide Kullanılabilme Potansiyelinin Araştırılması. TÜBİTAK_107S088, 2007-2010. Osteoporotik Sıçan Dokularında İskelet Kası Atrofisinin İmmünohistoloji Ve Moleküler Biyoloji Yöntemleriyle Araştırılması, TÜBİTAK, 2010-2011. Maternal Periferik Kanda Fetal Genomik DNA’nın Belirlenmesi. KB.SAG.004, 2005-2006, Dokuz Eylül Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı. Alkol Bağımlılığında Dopamin 2 Reseptör Geninin ve Kişilik Özelliklerinin Rolü, 2005-2007, Dokuz Eylül Üniversitesi Araştırma Fon Saymanlığı. ÖDÜLLER Prof. Dr. Yener AYTEKİN, Türkçe Bilim Dili Özel Ödülü 10. Ulusal Histoloji ve Embriyoloji Kongresi, 17-20 Mayıs 2010, Çeşme/İZMİR Fiziksel Egzersizde Endokanabinoidler Bağışıklık Sistemini Düzenlemektedir. Korkusuz P., Özdurak H., Zeybek D., Kocaefe Ç., Akpulat U., Kılıç E., Uçkan D., Şeker T., Korkusuz F. ÜYELİKLER Tıbbi Biyoloji ve Genetik Derneği YAYIN LİSTESİ A. Uluslararası Hakemli Dergilerde Yayınlanan Makaleler A.1. Ozdemir C, Akpulat U, Sharafi P, Yıldız Y, Onbaşılar I, Kocaefe C. Periostin is temporally expressed as an extracellular matrix component in skeletal muscle regeneration and differentiation. Gene. 2014 Dec 15;553(2):130-9. doi: 10.1016/j.gene.2014.10.014. A.2. Dalmıs A, Akvardar Y, Eresen C, Kızıldag S, Akpulat U, Yıldırımcan S, Arkar H, Akdede B, Alptekin K. The role of Dopamine 2 receptor gene and personality characteristics in alcohol dependence in Turkish population. ANATOLIAN JOURNAL OF PSYCHIATRY SEP 2014. doi:10.5455/apd.44724 A.3. Denizalti M, Bozkurt TE, Akpulat U, Sahin-Erdemli I, Abacıoğlu N. The vasorelaxant effect of hydrogen sulfide is enhanced in streptozotocin-induced diabetic rats. Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol. 2011 May;383(5):509-17. doi: 10.1007/s00210-011-0601-6. B. Uluslararası Kongrelerde Sunulan Uluslararası Hakemli Dergilerin Özel Sayılarında Yayınlanmış Bildiriler B.1. Akpulat U, Yildiz Y, Ozdemir C, Sharafi P, Onbasilar I, Kocaefe C. Klf5 modulates proliferation and differentiation of myoblasts. Muscle Res Cell Motil (2014) 35:65–142 DOI 10.1007/s10974-014-9384-y B.2. Akpulat U, Onbasilar I, Kocaefe C. SFRP2 designates skeletal muscle fibrosis in immobilized muscle. Muscle Res Cell Motil (2014) 35:65–142 DOI 10.1007/s10974-014-9384-y B.3. Gokcen A, Bal F, Akpulat U, Bozkurt K, Aktan E. A consaquineous couple with a 44,XY,der(13;14)der(13;14) and 45,XX,der(13;14) karyotypes and genetic counseling. Chromosome Research, Springer 2007, DOI: 10.1007/s10577-007-1911-x B.4. Bal F, Gokcen A¸ Karaman B, Baloğlu A, Cokısılak T, Akpulat U, Basaran S. X/Y translocation in a family with 4 affected members in 3 generation showing Leri-Weill dyschondrosteosis phenotype. Chromosome Research, Springer 2007, DOI: 10.1007/s10577007-1911-x B.5. Kitis A, Akvardar Y, Eresen C, Kizildag S, Akpulat U, Yildirimcan S , Alptekin K, Akdede B, Arkar H. The role of dopamine 2 receptor gene and personality characteristics in alcohol dependence in Turkish population. European Neuropsychopharmacology Volume 16, Supplement 4, 2006, Pages S491 doi:10.1016/S0924-977X(06)70661-7 C. Uluslararası Bilimsel Toplantılarda Sunulan ve Bildiri Kitabında Basılan Bildiriler C.1. Akpulat U., Yildiz Y., Sharafi P, Ozdemir C, Onbasilar I, Kocaefe C. A Novel Role for Krüppel-Like Factor 5 (KLF5) in the Differentiation and Regeneration of Skeletal Muscle. EMBO Workshop, Molecular Biology of Muscle Development and Regeneration, May 14 – 18, 2014 Acaya, Lecce, Italy (Poster) C.2. Akpulat U., Yildiz Y., Sharafi P, Ozdemir C, Onbasilar I, Kocaefe C. A Novel Role for Krüppel-Like Factor 5 (KLF5) in the Differentiation and Regeneration of Skeletal Muscle. 2nd International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey. 22-23 November 2013 Istanbul (Sözlü sunum) C.3. Akpulat U, Onbasilar I, Kocaefe C. SFRP2 designates skeletal muscle fibrosis in immobilized muscle. 42nd European Muscle Conference, 21-25 September 2013, Amsterdam, Netherlands (Poster). C.4. Akpulat U, Yildiz Y, Ozdemir C, Sharafi P, Onbasilar I, Kocaefe C. Klf5 modulates proliferation and differentiation of myoblasts. 42nd European Muscle Conference, 21-25 September 2013, Amsterdam, Netherlands (Poster). C.5. Akpulat U, Yildiz Y, Ozdemir C, Sharafi P, Onbasilar I, Kocaefe C. A novel role for a ubiquitous zinc finger Klf5 is a modulator of skeletal muscle differentiation and regeneration regulated by sumoylation. The 4th EMBO Meeting, Nice-France, 22-25 September 2012 (Poster) C.6. Ozdemir C, Akpulat U, Onbasilar I, Kocaefe C. Periostin is an extracellular matrix component expressed in the course of myogenic differentiation and regenerating muscle tissue. The 4th EMBO Meeting, Nice-France, 22-25 September 2012 (Poster) C.7. Yildiz Y, Akpulat U, Özdemir C, Sharafi P, Onbasilar I, Uren D, Kocaefe C. Klf5 is an emerging transcription factor with a role in skeletal muscle regeneration and differentiation. EMBO Molecular Medicine Conference, Molecular Insights for Innovative Therapies, EMBL Advanced Training Centre Heidelberg, Germany,01 – 03 December 2011 (Sözlü Sunum) C.8. Sharafi P, Akpulat U, Özdemir C, Cirak T, Onbasilar I, Kocaefe C. Adipocytes as Novel Cell Therapy Targets for Inherited Enzyme Deficiencies. EMBO Molecular Medicine Conference, Molecular Insights for Innovative Therapies, EMBL Advanced Training Centre Heidelberg, Germany,01 – 03 December 2011 (Poster) C.9. Sharafi P, Akpulat U, Özdemir C, Cirak T, Onbasilar I, Denktas E, Kocaefe C. Targetting Adipocytes as a Novel Cell Therapy Approach for Inherited Enzyme Deficiences. International Conference on Enzyme Science and Technology ,31 October – 04 November, 2011,KusadasıTurkey (Poster) C.10. Akpulat U, Onbasilar I, Sharafi P, Soylu R, Uren D, Kocaefe C. Utilization of Skeletal Muscle Immobilization Models for the Discovery of Novel Pathways and Mediatiors of Muscle Degeneration. Third ICLAS East Mediterranean Meeting, June 13 to 15, 2011, İstanbul-Turkey (Sözlü Sunum) C.11. Korkusuz F, Dagdeviren S, Uysal B, Korkusuz P, Zeybek D, Akpulat U, Yildiz Y, Kocaefe C. Gene expression and immunohistochemical changes in skeletal muscle after overiectomy and TNF-alpha administration in aged rats. Annual Meeting of the Association of Bone and Joint Surgeons, June 8 to 12, 2011, Dublin – Ireland (Poster) C.12. Korkusuz F, Zeybek D., Korkusuz P, Kocaefe C, Akpulat U, Yildiz Y, Kandilci H, Uysal B, Gumusel B, Dagdeviren S. TNF-alpha Antagonist Recovers Osteoporotic Skeletal Muscle Function. ORS-Orthopaedic Research Society 2011 Annual Meeting, Long Beach – California (Poster) C.13. Dagdeviren S., Zeybek D, Korkusuz P, Akpulat U, Yildiz Y, Kandilci B,Gumusel B, Korkusuz F. Analysis of Skeletal Muscle in Postmenopausal Osteoporotic Animal Model: The role of TNF-alpha. IMC17 - International Microscopy Congress, 2010,Rio-Brazil (Poster) C.14. Zeybek D, Kocaefe C, Akpulat U, Kilic E, Uckan Cetinkaya D, Korkusuz F, Ozdurak Singin H, Korkusuz P. Endocannabinoids Regulate Immune System During Exercise. IMC17 International Microscopy Congress, 2010, Rio – Brazil (Poster) C.15. Ozdurak Singin H, Kocaefe C, Korkusuz P, Akpulat U, Korkusuz F. Microarray analysis in lymphoid tissue following exhaustive endurance exercise. 14th Annual ECSS-Congress,2009, Oslo- Norway (Poster) C.16. Akpulat U, Ozdemir C, Onbasilar I, Kocaefe C. Endomysial fibrosis in tenotomy immobilized muscle is coupled with SFRP2 expression from slow-twitch fibers. The EMBO meeting, 29 August-1 September 2009, Amsterdam – Netherlands (Poster) D. Ulusal Bilimsel Toplantılarda Sunulan ve Bildiri Kitaplarında Basılan Bildiriler D.1. Akpulat U, Yıldız Y, Sharafi P, Özdemir C, Onbaşılar İ, Kocaefe Ç. Krüppel-like faktör 5 rejenerasyon sürecinde myoblastların proliferasyonu ve farklılaşması için gereklidir. 13’üncü Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, 27-30 Ekim 2013, Kuşadası – Aydın (Sözlü sunum) D.2. Akpulat U, Onbaşılar İ, Kocaefe Ç. İskelet kası deneysel modellerinin kas dejenerasyonunda yeni mediyatörlerin keşfi için önemi. 13’üncü Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, 27-30 Ekim 2013, Kuşadası – Aydın (Sözlü sunum) D.3. Akpulat U, Onbaşılar İ, Kocaefe Ç. SFRP2 kronik kas dejenerasyonu sürecinde iskelet kası fibrozisini kolaylaştırmaktadır. 13’üncü Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, 27-30 Ekim 2013, Kuşadası – Aydın (Poster) D.4. Dağdeviren S, Zeybek D, Korkusuz P, Kocaefe Ç, Akpulat U, Yıldız Y, Kandilci B, Uysal B, Gümüşel B, Korkusuz F. Postmenapozal osteoporoti hayvan modelinde iskelet kasının değerlendirilmesi: TNF-alfa’nın roü. 10’ncu Histoloji Embriyoloji Kongresi, 17-20 Mayıs 2010, Çeşme – İzmir (Sözlü sunum) D.5. Korkusuz P, Sıngın Özdurak H, Zeybek D, Kocaefe Ç, Akpulat U, Kılıç E, Uçkan D, Şeker T, Korkusuz F. Fiziksel egzersizde endokannabinoidler bağışıklık sistemini düzenlemektedir. 10’ncu Histoloji Embriyoloji Kongresi, 17-20 Mayıs 2010, Çeşme – İzmir (Sözlü sunum) D.6. Akpulat U, Onbaşılar İ, Kocaefe Ç. Kronik kas dejenerasyonu sürecinin microarray ekspresyon analizi ve fibrozis gelişiminde kas kök hücrelerinin rolü. 11’nci Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, 28 - 31 Ekim 2009, Bodrum – Muğla (Poster) D.7. Akpulat U, Eresen Ç, Kızıldağ S, Sercan O, Altunyurt S, Güçlü S, Celiloğlu M, Demir N, Sakızlı M. Maternal periferik kanda fetal genomik DNA’nın belirlenmesi. 10’ncu Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, 6 – 9 Eylül 2007, Antalya (Poster) D.8. Bal F, Gökçen A, Çokışılak T, Akpulat U. Amniyon Sıvısından Florasan in Situ Hibridizasyon (FISH) Yöntemi ile Anöploidi Tanısı. 7’nci Ulusal Prenatal Tanı Ve Tıbbi Genetik Kongresi, Mayıs 2006, Kayseri (Poster) D.9. Kızıldağ S, Genç Ş,Kılıç Y, Akpulat U, Sercan O, Sakızlı M. Çocukluk çağı akut lenfoblastik lösemide TEL/AML, BCR/ABL, MLL/AF4 kimerik gen ürünlerinin rt-PCR yöntemi ile saptanması. 6’ncı Ulusal Prenatal Tanı ve Tıbbi Genetik Kongresi, 21 – 24 Nisan 2004, Belek – Antalya (Poster)